Die EFAS und die Landeskirchen arbeiten beim Arbeits- und Gesundheitsschutz eng zusammen. Die tatsächliche Durchführung der Maßnahmen für Arbeits- und Gesundheitsschutz liegt bei den Arbeitgebern. Der Koordinator bzw. die Koordinatorin jeder Landeskirche organisiert gemeinsam mit den jeweiligen Ortskräften die Betreuung zum Arbeits- und Gesundheitsschutz ihrer Gemeinden.
Die EFAS stellt übergeordnet Informationsmaterialien zu aktuellen und wichtigen Themen des Arbeits- und Gesundheitsschutzes zur Verfügung, stets mit dem Ziel Unfälle zu vermeiden oder zu verringern. Im Rahmen regelmäßiger Treffen der Koordinatoren und der EFAS fördert die Fachstelle Austausch und Vernetzung der Akteure. Jede Landeskirche hat ihren direkten Ansprechpartner bei der EFAS.